Složení Rady určuje rektor (viz článek 5. Statutu Fondu mobility UK). V současnosti sestává Rada Fondu mobility z následujících členů.
Prof. MUDr. Jan Škrha, DrSc., Univerzita Karlova
Prof. PhDr. Martin Procházka, CSc., Filozofická fakulta
Dr. PhDr. Renáta Listíková, Pedagogická fakulta
Prof. MUDr. Jaroslav Pokorný, DrSc., 1. lékařská fakulta
Prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D., Farmaceutická fakulta v Hradci Králové
Prof. RNDr. Petr Kůrka, CSc., Centrum pro teoretická studia
RNDr. Aleš Soukup, Ph.D., Přírodovědecká fakulta
Mgr. Zdeněk Pressl, ÚJOP
Doc. PhDr. Běla Plechanovová, CSc., Fakulta sociálních věd
Prof. RNDr. Jaroslav Pokorný, CSc., Matematicko-fyzikální fakulta
Rada se schází alespoň dvakrát do roka, aby při jarním a podzimním kole Fondu mobility nestranně rozhodla o přidělených stipendiích.
Jednací řád Rady FM upravuje zatím pouze Statut Fondu mobility.