Systém vnitřního grantového financování na Univerzitě Karlově je tvořen mimo jiné Grantovou agenturou univerzity (GA UK).

GA UK zahájila svou činnost v roce 1993 a je interní grantovou agenturou UK, která podporuje vysokoškolský výzkum svých studentů. Je financována z prostředků MŠMT na specifický vysokoškolský výzkum. Ten rozlišuje studentské vědecké (grantové) projekty a studentské vědecké konference. Zatímco v soutěži SVV jsou možné oba typy těchto projektů, z prostředků GA UK je možné hradit pouze vědecké (grantové) projekty.

Zahájení soutěže se každoročně vyhlašuje nejpozději začátkem akademického roku opatřením rektora. Přihlášky nových projektů se podávají prostřednictvím aplikace GA UK, zhruba od října do listopadu. Konkrétní data opět každoročně stanovuje opatření rektora. V termínech zveřejněných v tomto opatření se podávají žádosti na rektorát souhrnně za fakultu. Pro podání přihlášky na fakultu jsou pro navrhovatele závazné fakultní termíny, které bývají zpravidla o několik dní dříve (informace o nich podá fakulta navrhovatele projektu - lhůtu pro podání přihlášek stanovuje děkan fakulty). Opatření rektora jsou vystaveny na webových stránkách Univerzity Karlovy a zveřejněny též na stránkách GA UK.

Podrobnější informace o soutěži zde: soutěž GAUK

Realizaci grantového financování upravují Zásady činnosti Grantové agentury Univerzity Karlovy, které po projednání ve vědecké radě univerzity vydává svým opatřením rektor; činnost GA UK se řídí Grantovým řádem Univerzity Karlovy ze dne 14. prosince 2016, na němž se usnesl Akademický senát UK jako na vnitřním předpisu a který byl registrován MŠMT.

Administrativní zajištění činnosti GA UK zabezpečuje rektorát - odbor pro vědu a výzkum, kancelář GA UK. Na zabezpečování grantového financování se podílejí Grantová rada univerzity, Dozorčí rada a Oborové rady GA UK - pro společenskovědní, přírodovědnou a lékařskou vědní oblast.