Kontrolní komise posuzuje dodržení podmínek, za kterých byla poskytnuta podpora podle Pravidel podpory zájmové činnosti studentů UK. Kontrolní komise má pět členů, členství v této komisi je neslučitelné s členstvím v sociální komisi senátu a se členstvím v hodnotící komisi. Členy této komise jmenuje a odvolává rektor, přičemž dva členy jmenuje na návrh senátu. Funkční období členů komise je dvouleté.
MUDr. Josef Fontana (3. LF)
prof. Ing. František Zahálka, Ph.D. (FTVS)
Mgr. Otomar Sláma (CPPT)
prof. ThDr. Jan Blahoslav Lášek (HTF)
Ing. Zuzana Beníšková (RUK)
2019 - 2021, březen
Mgr. Silvie Nedvědová (UK POINT)