Struktuta, organizace a dynamika chromatinu
Projekt je zaměřen na vysoce kompetitivní oblast biomedicíny - chromatin, jehož struktura, organizace a dynamika podmiňuje veškeré funkce genomu. Na stavu chromatinu závisí chování, metabolismus a osud buňky. Cíle projektu vychází z již dosažených výsledků a budou zaměřeny na studium mechanizmů regulace genové exprese od úrovně nukleozomu po prostorové uspořádání chromozomových teritorií. Konkrétně se jedná o studium nukleozomální struktury, organizace genomu ve virech, umlčování genů, transkripce a syntézy rDNA, post-transkripčních úprav RNA, asociace prionů s chromatinem, struktury chromatinu během embryogeneze a vlivu organizace chromatinu na regulaci jadernými receptory. Budou pro to používány modelové savčí/lidské buněčné linie, buňky z vybraného klinického materiálu a modelové organizmy. Vedle využití genetických, biochemických a molekulárně-biologických přístupů řešitelé použijí k zastřešení řešení projektu nejmodernější mikroskopické metody zahrnující 4D pozorování buněk, superrezoluční mikroskopii, elektronovou kryo-mikroskopii hydratovaných preparátů, elektronovou tomografii, "single particle analysis" a korelační světelnou a elektronovou mikroskopii.